实验原理
分子对接（Molecular Docking）是一种用于预测小分子与蛋白质潜在结合方式的计算分析方法。本流程基于 AutoDock Vina，对受体蛋白和候选配体进行结构预处理，并通过盲对接搜索蛋白表面潜在结合区域，获得不同结合构象及对应的结合亲和力评分。
在获得对接结果后，系统自动筛选代表性结合构象，进一步分析配体与周围氨基酸残基之间的氢键、疏水作用等相互作用，并生成结合位点局部结构图、蛋白-配体整体结构图及二维相互作用图，从而直观展示候选化合物的潜在结合模式。
分子对接
1、技术简介
应用场景
分子对接可用于候选化合物初步筛选、天然产物与靶蛋白结合分析、潜在结合位点预测及蛋白-配体相互作用可视化等场景。用户可通过 PDB ID 或上传蛋白结构文件提交受体，并通过 PubChem CID 或上传配体结构文件添加 1–5 个候选化合物，系统支持批量完成对接并对不同配体的预测结果进行比较。
最终可获得对接评分、候选结合构象、结合位点及关键氨基酸相互作用信息，并自动生成适用于结果展示和论文配图的结构可视化结果。
2、如何获取配受体ID
3、平台操作
选择左侧步骤
点击受体配置、配体配置或对接参数，在这里设置对应任务信息。
| ID | 流程名称 | 流程进度 | 预计运行时间 | 创建时间 | 更新时间 | 操作 |
|---|
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任务成功后，选择分析记录即可预览 scores、结合位点图与 2D 相互作用图。